Das Schmallenberg-Virus wird durch blutsaugende Insekten (v. a. Gnitzen und Stechmücken) sowie wie vertikal vom Muttertier auf den Fetus übertragen. Akute Infektionen treten daher vorwiegend von April bis November auf, wenn die Vektoren aktiv sind. Bei Rindern kann es zu Fieber, Durchfall und Milchrückgang kommen, adulte Schafe zeigen nur selten klinische Symptome. Bei Erst-Infektionen in der vulnerablen Phase der Trächtigkeit (Rind: Tag 75–175, Schaf: Tag 30–50) kommt es zu kongenitalen Missbildungen der Feten (Arthrogrypose-Hydranencephalie-Syndrom), die mit Aborten, Totgeburten oder der Geburt lebensschwacher Jungtiere einhergehen.
Die Infektion mit dem Schmallenberg-Virus ist derzeit nicht im Animal Health Law (AHL) der EU gelistet (Stand Oktober 2026), in Deutschland jedoch gemäß § 4 TierSeuchMeldV meldepflichtig (betroffene Tierarten siehe dort).
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