Der Pathomechanismus einer ASIT beinhaltet eine Modulation einer Th2- zu einer Th1- Zellantwort und verändert das Immunsystem dahingehend, dass eine allergische Reaktion des Organismus ausbleibt.
Allergische Erkrankungen sind nicht heilbar, jedoch in 70-80 % der Fälle mit Hilfe der Allergen-spezifischen Immuntherapie gut kontrollierbar. In manchen Fällen kommt es bereits nach einigen Wochen zu einer deutlichen Verbesserung, in anderen Fällen jedoch dauert es 10 Monate oder länger, bis eine klinische Verbesserung sichtbar wird. Bei gutem Ansprechen auf die Therapie empfiehlt es sich, diese unbedingt lebenslang durchzuführen. Die Immuntherapie sollte daher auch nach Symptombesserung oder Symptomfreiheit unbedingt fortgesetzt werden.